La République de Djibouti et le Royaume du Maroc ont établi leurs relations diplomatiques le 14 Mars 1978. En 2007, Les deux pays frères ont convenu de prendre un nouvel élan dans leurs relations et ont décidé de créer une haute commission mixte.
En vue de consolider les relations bilatérales entre les deux pays, la République de Djibouti a décidé d’ouvrir une représentation diplomatique à Rabat. Le 27 Juin 2012, l’Ambassade de Djibouti à Rabat a été inaugurée. Dès lors, les deux pays entretiennent une collaboration privilégiée menant à un excellent niveau de coopération dans plusieurs domaines prioritaires (Enseignement supérieur, Santé, Energie….) et contribuant au développement du pays.
En guise de l’excellente relation d’amitié, de solidarité et de respect mutuel entre les deux pays, la République de Djibouti a ouvert, en 2020, un Consulat Général à Dakhla pour apporter son soutien constant au respect de l’intégrité territoriale du Maroc.